La Misión Metodista Libre Ecuatoriana, con la bendición de Dios y el apoyo de la IML de los Estados Unidos ha logrado establecer los siguientes ministerios y programas para el fortalecimiento de las iglesias filiales:
1- Child Care International (cuidado de niños)
2- Instituto Teológico por Extensión (INSTE)
3- Evangelismo (Liga Bíblica Internacional)
4- Amigos de Ecuador (programa financiero)